藤田医科大学 医学部
 微生物学講座・感染症科

Department of Microbiology / Department of Infectious Diseases,
Fujita Health University School of Medicine

Ubuntu Server 22.04メモ

headless Serverで運用する

X window systemはディスプレイを繋げないと動かない？
NoMachineは繋げたディスプレイの解像度しか使えない？
色々不便で調べてうまくいった方法（最良なのか？は不明）。

  1. nouveauをblacklistして、Nvidiaドライバーはインストール済み
  2. EDIDファイルの準備(https://edid.tv/からダウロードした)
  3. /etc/X11/xorg.confに下記を追加 
    
Section "Screen"
	Identifier     "Screen0"
    Device         "Device0"
    Monitor        "Monitor0"
    DefaultDepth    24
    Option         "AllowEmptyInitialConfiguration" "True"
    Option         "UseDisplayDevice" "DP-0"
    Option         "ModeValidation" "NoDFPNativeResolutionCheck"
    Option         "ConnectedMonitor" "DP-0"
    Option         "CustomEDID" "DP-0:/etc/X11/junk.edid" # EDIDファイルのPATH
    	SubSection     "Display"
    	Depth       24
    	EndSubSection
EndSection
  4. reboot

Scientific Linux 7メモ

NVIDIAドライバーのインストール

defaultではnouveauドライバとなっているので、NVIDIAのドライバに変える

  1. #ランレベルを３にする
    $systemctl set-default multi-user.target
  2. $systemctl get-default
    ＃multi-user.targetと返ってくればOK
  3. reboot
  4. noveauの確認　
    $lsmod | grep nouveau
  5. デフォルトimgのバックアップ
    # mv /boot/initramfs-$(uname -r).img /boot/initramfs-$(uname -r)-nouveau.img
  6. nouveauドライバをロードしない起動イメージファイルを作成
    #dracut --omit-drivers nouveau /boot/initramfs-$(uname -r).img $(uname -r)
  7. noveauのブラックリスト化
    #vi /etc/modprobe.d/modprobe.conf に下記を追加
    #
    # /etc/modprobe.d/modprobe.conf (to omit nouveau driver)
    #
    blacklist nouveau

    vi /etc/modprobe.d/nouveau_blacklist.conf　に下記を追加
    blacklist nouveau
  8. reboot
  9. noveauの確認　
    $lsmod | grep nouveau　で何も出なければOK
  10. NVIDIAのドライバをdownloadしてinstall
  11. #ランレベルを5にする
    $systemctl set-default graphical.target

キーボードレイアウト変更

キーボード設定の表示
$ localectl status

キーボードリストの表示
$localectl list-keymaps

キーマップの指定
$localectl set-keymap jp106

PyMOLのインストール

sourceをダウンロードしてから
$ export CPPFLAGS="-std=c++0x"
$ python setup.py build install

Scientific Linux 6メモ

バックアップ関係

rsyncメモ
  • 基本　
    $rsync -av dir1 dir2 dir3
  • 最後に書いたディレクトリに同期される。
  • -e ssh　でssh接続したネットワーク先も保存可
  • --delete　で同期元に無いファイルは同期先でも消える
（回折イメージなどの）バックアップ確認
  • diff -r dir1 dir2
バックアップが遅い

read only のファイルができてる　→　ファイルシステムが壊れてる？

  • fsck -y

kernel:Disabling IRQ #17の対処

RTL8111Eののドライバがr8169では問題（？）があるみたいで、r8168に変更

  1. elrepoからkmod-r8168をインストール
  2. lsmod | grep r8168　で確認

ネットワーク関係の設定ファイルは　/etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0

FirefoxからChromeへ移行

導入Extension

  1. Xmarks Bookmark Sync
  2. Smooth Gestures
  3. Tab Position Customizer

システム丸ごとバックアップ

バックアップ
  1. clonezillaからダウンロードし、LiveCDを作成
  2. LiveCDを起動
  3. あとは指示されるがまま進めばOK
バックアップしたファイルをimgに変換して、一部のファイルだけを抜き出せるようにする
  1. Partcloneをダウンロード
  2. patchを作成[ファイル](参考http://www.redhat.com/archives/rhl-list/2009-November/msg01261.html)
  3. $patch < configure.patch
  4. $./configure --prefix=/usr/local/ --enable-hfsp --enable-fat --enable-extfs --enable-ntfs --enable-dependency-tracking --enable-ncursesw --with-gnu-ld
  5. makeして、make install
  6. $cd /home/partimag/YOURIMAGE/
  7. $touch hda2.img
  8. $cat dir/hda2.ntfs-ptcl-img.gz.* | gzip -d -c | partclone.restore -C -s - -O hda2.img
  9. $mount -o loop hda2.img /mnt

RainlendarとGoogle calendarを同期(GCALDaemon)

Google calendarとRainlendarを同期する（双方向）

  1. ダウンロードして、/usr/local/sbinにファイルを展開
  2. $GCALDaemon/bin/password-encoder.sh　をチェック
  3. ↑でencode
  4. $GCALDaemon/conf/gcal-daemon.cfg　を編集
  5. $GCALDaemon/bin/standalone-start.sh　をスタート

これで、デフォルトで15分毎に更新される
変更したければgcal-daemon.cfgのfile.polling.googleの値を変える

RainlendarとGoogle calendarを同期(シェルスクリプト)

Google calendarに書き込んだ予定をRainlendarに反映させるメモ（一方向）

1. シェルスクリプトの作成
（注意！）ファイル内はフルパスで書いた方が無難

    • #!/bin/sh
    • export https_proxy=<PROXY url>
    • rm <full PATH>/basic.ics
    • /usr/bin/wget https://<Google calendar url>
    • mv ~/basic.ics <full PATH>/basic.ics

2. cronで自動実行

$crontab -e

    • #実行した確認メールはいらない
    • MAILTO=""
    • #3時間おきに同期
    • * /*3 * * * /bin/bash <full PATH>/basic.ics

MozcをRPMから導入

（参考）
Smiling Lifeさんのページ　http://blog.livedoor.jp/rootan2007/archives/51730263.html

  1. epelからprotobufをインストール
  2. 下のVine LinuxのRPMファイルをダウンロード

    　 ibus-mozc-1.1.717.102-2vl6.x86_64.rpm
    　 mozc-1.1.717.102-2vl6.x86_64.rpm
    　 mozc-server-1.1.717.102-2vl6.x86_64.rpm
    　 mozc-utils-gui-1.1.717.102-2vl6.x86_64.rpm
    　 tegaki-zinnia-japanese-0.3-1vl6.noarch.rpm
    　 zinnia-0.06-3vl6.x86_64.rpm
  3. 上のファイルのインストール
  4. reboot
  5. インプットメソッドを変更

Mozcのコンパイル

rpmからだとmozc_toolがセグメントエラーで使えないのでコンパイル

  1. $svn co http://src.chromium.org/svn/trunk/tools/depot_tools
  2. $export PATH=`pwd`/depot_tools:"$PATH"
  3. $mkdir -p ~/src/mozc
  4. $cd ~/src/mozc
  5. $gclient config http://mozc.googlecode.com/svn/trunk/src
  6. $gclient sync
  7. $cd ~/src/mozc/src
  8. ($export QTDIR=/usr/lib64/qt4 (defaultではqt-3.3になってしまう))
  9. $python build_mozc.py gyp
  10. $python build_mozc.py build_tools -c Release
  11. $python build_mozc.py build -c Release unix/ibus/ibus.gyp:ibus_mozc gui/gui.gyp:mozc_tool

辞書追加方法：$mozc_tool --mode=dictionary_tool

(111012)　コンパイルしたibus-mozcはうまく動かない

NVIDIAのドライバ導入

defaultではnouveauドライバとなっているので、NVIDIAのドライバに変える

  1. （/boot/grub/grub.conf のkernelの最後に "rdblacklist=nouveau nouveau.modeset=0"を追加）
  2. /etc/modprobe.d/blacklist.conf　に"blacklist nouveau"を追加
  3. /etc/inittab　を編集してinit 3で立ち上がるようにする
  4. reboot
  5. NVIDIAのドライバをdownloadしてinstall
  6. #nvidia-xconfig　でxorg.confを作成
  7. （/etc/X11/xorg.confにOptionを追加）
    • Section "Device"
    • Option "XAANoOffscreenPixmaps" "true"
    • Option "AllowGLXWithComposite" "true"
    • EndSection
    • Section "Screen"
    • Option "AddARGBGLXVisuals" "true"
    • EndSection
    • Section "Extensions"
    • Option "Composite" "enable"
    • EndSection

(110602)　kernelをupdateする場合はrun levelを3にして、ドライバを入れ直す。

(111004)　1と6の作業は要らない？

yumの設定

yumにProxyを通し、kernelのパッケージを除く

/etc/yum/yum.conf に追加

    • proxy=http://プロキシサーバ名:プロキシポート
    • proxy_username=プロキシ認証ユーザ
    • proxy_password=プロキシ認証パスワード
    • exclude = kernel*

PROXYの設定

proxyの環境変数を設定

rootで /etc/profile.d/PROXY.sh を作成

    • export http_proxy=http://プロキシサーバ名:プロキシポート
    • export HTTP_PROXY=http://プロキシサーバ名:プロキシポート
    • export https_proxy=http://プロキシサーバ名:プロキシポート
    • export HTTPS_PROXY=http://プロキシサーバ名:プロキシポート
    • export ftp_proxy=http://プロキシサーバ名:プロキシポート
    • export FTP_PROXY=http://プロキシサーバ名:プロキシポート

VirtualBoxの設定

共有ホルダを使用できるようにする

  • VirtualBoxマネージャーで共有ホルダを設定
  • ホストを立ち上げた後に、デバイス＞Guest Additionのインストール　を実行

VirtualBoxのゲストOSの容量を増やす

  1. 新規仮想イメージの作成
  2. 既存イメージをコピー
    • cd ~/VirtualBOX VMs/
    • VBoxManage clonehd /old.vdi /new.vdi --existing
  3. 新規イメージで起動
  4. EASEUS Partition Masterをダウンロードして、パーティションを変更

quotaでディレクトリの使用容量制限 (120427)

  1. /etc/fstab　にusrquotaを書き込む＜br/>/dev/hda3 /home ext2defaults,usrquota 1 1
  2. #mount -o remount /home
  3. #/sbin/quotacheck -um /home
  4. #/usr/sbin/edquoata -u user name
  5. softとhardに制限量を書き込む（キロバイト単位）
  6. #/usr/sbin/repquota -a
  7. #/sbin/quotaon -av
  8. /etc/rc.d/ にrc.quotaを作成
    • #!/bin/sh
    • #
    • # Check quota and then turn quota on.
    • if [ -x /sbin/quotacheck ]
    • then
    • echo "Checking quotas. This may take some time."
    • /sbin/quotacheck -avug
    • echo " Done."
    • fi
    • if [ -x /sbin/quotaon ]
    • then
    • echo "Turning on quota."
    • /sbin/quotaon -avug
    • fi
  9. #chmod 755 rc.quota
  10. rc.local に書き込む
    • if [ -x /etc/rc.d/rc.quota ]; then
    • echo -n "Starting quota "
    • /etc/rc.d/rc.quota start
    • echo "."
    • fi

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