「アセンブリ教育センター」は2017年4月に設立され、センター長、副センター長、専任の事務職員で構成されています。また、副センター長と各学部、研究推進本部の教員、事務職員、学生代表からなる「アセンブリ活動推進室」を設け、各アセンブリの活動内容の改善・決定を行っています。さらに、アセンブリⅠ~アセンブリⅣではそれぞれ「運営委員会」を設けており、運営委員がアセンブリの授業運営を担っています。
これらの組織が運営するアセンブリ教育を通じて、本学の学生が医療の専門職として社会に貢献するための多職種連携の基盤づくりを行います。